新平台可绘制亚细胞精度的组织3D图

2024-07-30 142 0

  科技日报北京6月26日电 德国马克斯·德尔布吕克中心尼古拉斯·拉杰斯基实验室团队开发出一种名为Open-ST的空间转录平台,能以三维(3D)方式重建患者组织细胞内的基因表达,并以亚细胞精度绘制出组织样本的分子图谱。相关论文发表在新一期《细胞》杂志上。,  转录组学是研究细胞或细胞群中基因表达的学科,通常不包括空间信息,而空间转录组学则能测量组织样本中RNA在空间中的表达。Open-ST平台提供了一种经济高效、高分辨率、易于使用的方法,既可以拍摄样本的组织形态,也能拍摄组织切片的空间转录组学信息。该平台可以利用一系列2D图像,将其重建为3D“虚拟立体组织”。,  Open-ST平台根据癌症组织样本绘制的图像,突出显示了3D肿瘤或淋巴结边界处的潜在生物标记,这些标记可能成为新的药物靶点。而这些潜在生物标记在2D分析中是不可见的。,  目前,研究人员已将整个实验和计算工作流程免费开放,以便广泛使用。(记者张佳欣),